Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAPSNQ13702 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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