Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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NAE1Q13564 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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NAE1Q13564 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
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NAE1Q13564 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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NAE1Q13564 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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NAE1Q13564 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NAE1Q13564 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NAE1Q13564 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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