Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
EIF4EBP1Q13541 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms