Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
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TUBB3Q13509 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TUBB3Q13509 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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