Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE3BQ13370 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
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