Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AP3B2Q13367 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms