Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SP140Q13342 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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SP140Q13342 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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SP140Q13342 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP140Q13342 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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SP140Q13342 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SP140Q13342 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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SP140Q13342 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SP140Q13342 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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SP140Q13342 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SP140Q13342 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SP140Q13342 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SP140Q13342 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SP140Q13342 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SP140Q13342 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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