Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME3Q13232 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME3Q13232 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME3Q13232 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NME3Q13232 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME3Q13232 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME3Q13232 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME3Q13232 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME3Q13232 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME3Q13232 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME3Q13232 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME3Q13232 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME3Q13232 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME3Q13232 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME3Q13232 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NME3Q13232 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME3Q13232 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NME3Q13232 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME3Q13232 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NME3Q13232 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NME3Q13232 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME3Q13232 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NME3Q13232 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME3Q13232 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME3Q13232 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME3Q13232 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME3Q13232 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME3Q13232 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME3Q13232 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME3Q13232 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME3Q13232 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME3Q13232 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME3Q13232 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME3Q13232 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME3Q13232 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME3Q13232 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME3Q13232 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME3Q13232 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME3Q13232 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME3Q13232 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME3Q13232 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME3Q13232 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME3Q13232 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME3Q13232 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME3Q13232 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME3Q13232 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME3Q13232 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME3Q13232 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME3Q13232 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME3Q13232 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME3Q13232 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME3Q13232 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME3Q13232 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME3Q13232 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME3Q13232 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME3Q13232 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME3Q13232 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME3Q13232 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME3Q13232 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME3Q13232 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME3Q13232 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME3Q13232 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME3Q13232 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME3Q13232 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME3Q13232 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME3Q13232 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME3Q13232 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NME3Q13232 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME3Q13232 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME3Q13232 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME3Q13232 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME3Q13232 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME3Q13232 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME3Q13232 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME3Q13232 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME3Q13232 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME3Q13232 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME3Q13232 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME3Q13232 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME3Q13232 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME3Q13232 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME3Q13232 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME3Q13232 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME3Q13232 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME3Q13232 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME3Q13232 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME3Q13232 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME3Q13232 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME3Q13232 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME3Q13232 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME3Q13232 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME3Q13232 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME3Q13232 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME3Q13232 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME3Q13232 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME3Q13232 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME3Q13232 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME3Q13232 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME3Q13232 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME3Q13232 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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