Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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CHAF1BQ13112 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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