Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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TRAF2Q12933 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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TRAF2Q12933 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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TRAF2Q12933 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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TRAF2Q12933 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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TRAF2Q12933 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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TRAF2Q12933 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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TRAF2Q12933 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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TRAF2Q12933 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRAF2Q12933 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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TRAF2Q12933 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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TRAF2Q12933 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF2Q12933 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
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