Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms