Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms