Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 KCNIP1-208ENST00000520740 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABPB1Q06547 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms