Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IRF9Q00978 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms