Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERFP50548 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERFP50548 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERFP50548 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERFP50548 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERFP50548 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERFP50548 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERFP50548 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERFP50548 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERFP50548 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERFP50548 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ERFP50548 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ERFP50548 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ERFP50548 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERFP50548 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERFP50548 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERFP50548 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERFP50548 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERFP50548 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERFP50548 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERFP50548 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERFP50548 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERFP50548 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERFP50548 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERFP50548 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERFP50548 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERFP50548 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERFP50548 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERFP50548 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERFP50548 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ERFP50548 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERFP50548 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERFP50548 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERFP50548 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERFP50548 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERFP50548 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERFP50548 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERFP50548 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERFP50548 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERFP50548 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERFP50548 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERFP50548 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERFP50548 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERFP50548 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERFP50548 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERFP50548 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERFP50548 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERFP50548 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERFP50548 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERFP50548 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERFP50548 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERFP50548 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERFP50548 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERFP50548 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERFP50548 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERFP50548 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERFP50548 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERFP50548 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ERFP50548 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERFP50548 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERFP50548 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ERFP50548 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERFP50548 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERFP50548 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERFP50548 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERFP50548 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERFP50548 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERFP50548 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERFP50548 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERFP50548 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERFP50548 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERFP50548 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERFP50548 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERFP50548 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERFP50548 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERFP50548 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERFP50548 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERFP50548 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERFP50548 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERFP50548 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERFP50548 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERFP50548 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERFP50548 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERFP50548 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERFP50548 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERFP50548 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERFP50548 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ERFP50548 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERFP50548 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERFP50548 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERFP50548 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERFP50548 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERFP50548 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERFP50548 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERFP50548 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERFP50548 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ERFP50548 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERFP50548 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERFP50548 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERFP50548 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms