Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PTDSS1P48651 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTDSS1P48651 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTDSS1P48651 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.8 ms