Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UTRNP46939 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UTRNP46939 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UTRNP46939 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UTRNP46939 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UTRNP46939 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UTRNP46939 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UTRNP46939 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UTRNP46939 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UTRNP46939 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UTRNP46939 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UTRNP46939 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
UTRNP46939 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UTRNP46939 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UTRNP46939 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UTRNP46939 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UTRNP46939 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UTRNP46939 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UTRNP46939 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
UTRNP46939 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UTRNP46939 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UTRNP46939 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UTRNP46939 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UTRNP46939 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UTRNP46939 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UTRNP46939 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UTRNP46939 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UTRNP46939 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UTRNP46939 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UTRNP46939 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UTRNP46939 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UTRNP46939 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UTRNP46939 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UTRNP46939 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UTRNP46939 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UTRNP46939 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UTRNP46939 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
UTRNP46939 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UTRNP46939 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UTRNP46939 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UTRNP46939 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UTRNP46939 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UTRNP46939 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UTRNP46939 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UTRNP46939 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UTRNP46939 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UTRNP46939 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UTRNP46939 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UTRNP46939 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UTRNP46939 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UTRNP46939 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UTRNP46939 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UTRNP46939 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UTRNP46939 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UTRNP46939 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UTRNP46939 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UTRNP46939 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UTRNP46939 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UTRNP46939 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UTRNP46939 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UTRNP46939 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UTRNP46939 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UTRNP46939 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UTRNP46939 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UTRNP46939 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UTRNP46939 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UTRNP46939 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UTRNP46939 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UTRNP46939 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UTRNP46939 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UTRNP46939 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
UTRNP46939 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UTRNP46939 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
UTRNP46939 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UTRNP46939 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UTRNP46939 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UTRNP46939 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UTRNP46939 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
UTRNP46939 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
UTRNP46939 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UTRNP46939 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UTRNP46939 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UTRNP46939 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UTRNP46939 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UTRNP46939 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UTRNP46939 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UTRNP46939 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
UTRNP46939 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UTRNP46939 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UTRNP46939 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UTRNP46939 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UTRNP46939 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UTRNP46939 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UTRNP46939 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
UTRNP46939 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UTRNP46939 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UTRNP46939 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UTRNP46939 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UTRNP46939 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UTRNP46939 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms