Protein–RNA interactions for Protein: P46063

RECQL, ATP-dependent DNA helicase Q1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQLP46063 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RECQLP46063 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RECQLP46063 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RECQLP46063 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RECQLP46063 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RECQLP46063 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RECQLP46063 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RECQLP46063 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RECQLP46063 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RECQLP46063 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RECQLP46063 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RECQLP46063 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RECQLP46063 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RECQLP46063 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RECQLP46063 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RECQLP46063 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RECQLP46063 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RECQLP46063 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RECQLP46063 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RECQLP46063 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RECQLP46063 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RECQLP46063 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RECQLP46063 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RECQLP46063 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RECQLP46063 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RECQLP46063 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RECQLP46063 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RECQLP46063 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RECQLP46063 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RECQLP46063 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RECQLP46063 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RECQLP46063 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RECQLP46063 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RECQLP46063 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RECQLP46063 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RECQLP46063 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RECQLP46063 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RECQLP46063 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RECQLP46063 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RECQLP46063 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RECQLP46063 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RECQLP46063 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RECQLP46063 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RECQLP46063 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RECQLP46063 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RECQLP46063 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RECQLP46063 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RECQLP46063 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RECQLP46063 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RECQLP46063 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RECQLP46063 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RECQLP46063 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RECQLP46063 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RECQLP46063 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RECQLP46063 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RECQLP46063 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RECQLP46063 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RECQLP46063 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RECQLP46063 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RECQLP46063 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RECQLP46063 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RECQLP46063 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RECQLP46063 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RECQLP46063 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RECQLP46063 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RECQLP46063 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RECQLP46063 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RECQLP46063 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RECQLP46063 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RECQLP46063 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RECQLP46063 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RECQLP46063 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RECQLP46063 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RECQLP46063 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RECQLP46063 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RECQLP46063 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RECQLP46063 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RECQLP46063 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RECQLP46063 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RECQLP46063 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RECQLP46063 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RECQLP46063 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RECQLP46063 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RECQLP46063 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RECQLP46063 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RECQLP46063 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RECQLP46063 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RECQLP46063 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RECQLP46063 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RECQLP46063 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RECQLP46063 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RECQLP46063 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RECQLP46063 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RECQLP46063 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RECQLP46063 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RECQLP46063 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RECQLP46063 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RECQLP46063 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RECQLP46063 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RECQLP46063 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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