Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPA3P35244 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPA3P35244 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPA3P35244 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RPA3P35244 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPA3P35244 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPA3P35244 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPA3P35244 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPA3P35244 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPA3P35244 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPA3P35244 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPA3P35244 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPA3P35244 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPA3P35244 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPA3P35244 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPA3P35244 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPA3P35244 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPA3P35244 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPA3P35244 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPA3P35244 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPA3P35244 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPA3P35244 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPA3P35244 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPA3P35244 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RPA3P35244 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPA3P35244 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPA3P35244 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPA3P35244 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPA3P35244 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPA3P35244 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPA3P35244 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPA3P35244 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPA3P35244 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPA3P35244 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPA3P35244 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPA3P35244 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPA3P35244 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPA3P35244 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPA3P35244 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPA3P35244 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPA3P35244 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPA3P35244 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPA3P35244 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPA3P35244 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPA3P35244 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPA3P35244 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPA3P35244 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RPA3P35244 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RPA3P35244 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPA3P35244 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPA3P35244 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPA3P35244 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPA3P35244 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPA3P35244 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RPA3P35244 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPA3P35244 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPA3P35244 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPA3P35244 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RPA3P35244 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPA3P35244 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPA3P35244 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPA3P35244 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPA3P35244 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPA3P35244 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPA3P35244 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPA3P35244 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPA3P35244 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPA3P35244 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPA3P35244 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPA3P35244 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPA3P35244 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPA3P35244 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPA3P35244 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPA3P35244 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPA3P35244 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPA3P35244 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPA3P35244 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RPA3P35244 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPA3P35244 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPA3P35244 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPA3P35244 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPA3P35244 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPA3P35244 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPA3P35244 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPA3P35244 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPA3P35244 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPA3P35244 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPA3P35244 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPA3P35244 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPA3P35244 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPA3P35244 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPA3P35244 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPA3P35244 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPA3P35244 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPA3P35244 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPA3P35244 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RPA3P35244 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPA3P35244 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPA3P35244 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPA3P35244 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms