Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-FP30511 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms