Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB4P28070 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms