Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CXCL3P19876 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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CXCL3P19876 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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CXCL3P19876 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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CXCL3P19876 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL3P19876 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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