Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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