Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRAP18433 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRAP18433 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms