Protein–RNA interactions for Protein: P17707

AMD1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMD1P17707 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
AMD1P17707 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMD1P17707 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMD1P17707 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMD1P17707 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMD1P17707 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMD1P17707 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMD1P17707 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMD1P17707 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMD1P17707 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMD1P17707 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMD1P17707 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMD1P17707 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMD1P17707 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMD1P17707 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMD1P17707 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMD1P17707 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMD1P17707 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMD1P17707 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMD1P17707 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMD1P17707 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMD1P17707 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMD1P17707 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMD1P17707 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMD1P17707 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMD1P17707 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMD1P17707 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMD1P17707 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMD1P17707 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMD1P17707 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMD1P17707 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMD1P17707 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMD1P17707 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
AMD1P17707 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMD1P17707 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMD1P17707 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMD1P17707 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
AMD1P17707 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMD1P17707 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMD1P17707 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMD1P17707 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMD1P17707 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMD1P17707 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMD1P17707 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMD1P17707 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMD1P17707 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMD1P17707 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMD1P17707 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMD1P17707 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
AMD1P17707 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMD1P17707 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMD1P17707 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMD1P17707 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMD1P17707 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMD1P17707 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMD1P17707 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMD1P17707 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
AMD1P17707 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMD1P17707 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMD1P17707 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMD1P17707 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMD1P17707 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMD1P17707 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMD1P17707 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMD1P17707 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMD1P17707 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMD1P17707 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMD1P17707 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMD1P17707 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMD1P17707 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMD1P17707 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMD1P17707 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
AMD1P17707 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
AMD1P17707 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMD1P17707 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMD1P17707 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMD1P17707 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
AMD1P17707 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
AMD1P17707 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMD1P17707 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMD1P17707 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMD1P17707 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMD1P17707 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
AMD1P17707 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMD1P17707 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMD1P17707 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMD1P17707 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMD1P17707 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMD1P17707 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMD1P17707 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMD1P17707 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMD1P17707 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMD1P17707 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMD1P17707 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMD1P17707 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMD1P17707 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
AMD1P17707 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMD1P17707 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMD1P17707 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMD1P17707 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms