Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HOXD8P13378 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms