Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC172P0C7W6 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms