Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOP08100 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOP08100 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOP08100 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOP08100 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOP08100 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOP08100 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOP08100 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOP08100 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOP08100 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOP08100 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOP08100 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOP08100 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOP08100 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOP08100 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RHOP08100 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RHOP08100 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RHOP08100 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RHOP08100 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RHOP08100 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RHOP08100 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RHOP08100 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RHOP08100 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RHOP08100 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RHOP08100 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOP08100 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOP08100 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOP08100 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOP08100 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOP08100 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOP08100 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOP08100 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOP08100 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOP08100 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOP08100 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOP08100 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOP08100 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOP08100 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOP08100 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOP08100 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOP08100 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOP08100 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOP08100 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOP08100 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOP08100 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOP08100 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOP08100 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOP08100 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOP08100 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOP08100 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOP08100 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOP08100 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOP08100 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOP08100 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOP08100 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOP08100 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOP08100 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RHOP08100 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOP08100 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOP08100 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOP08100 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOP08100 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOP08100 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOP08100 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOP08100 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOP08100 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOP08100 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOP08100 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOP08100 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOP08100 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOP08100 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOP08100 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOP08100 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOP08100 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOP08100 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOP08100 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOP08100 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOP08100 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOP08100 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOP08100 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOP08100 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOP08100 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOP08100 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOP08100 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOP08100 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOP08100 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOP08100 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOP08100 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOP08100 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOP08100 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RHOP08100 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOP08100 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOP08100 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOP08100 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOP08100 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOP08100 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOP08100 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOP08100 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOP08100 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOP08100 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms