Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HLA-DQB1P01920 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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