Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POP4O95707 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POP4O95707 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POP4O95707 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POP4O95707 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
POP4O95707 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POP4O95707 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POP4O95707 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
POP4O95707 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POP4O95707 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POP4O95707 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POP4O95707 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POP4O95707 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
POP4O95707 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POP4O95707 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POP4O95707 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POP4O95707 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POP4O95707 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POP4O95707 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POP4O95707 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POP4O95707 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POP4O95707 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POP4O95707 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POP4O95707 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POP4O95707 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POP4O95707 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POP4O95707 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POP4O95707 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POP4O95707 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POP4O95707 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POP4O95707 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POP4O95707 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POP4O95707 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POP4O95707 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POP4O95707 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POP4O95707 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POP4O95707 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POP4O95707 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POP4O95707 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POP4O95707 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POP4O95707 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POP4O95707 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POP4O95707 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POP4O95707 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
POP4O95707 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
POP4O95707 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POP4O95707 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POP4O95707 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POP4O95707 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POP4O95707 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POP4O95707 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POP4O95707 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POP4O95707 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POP4O95707 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POP4O95707 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POP4O95707 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
POP4O95707 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POP4O95707 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
POP4O95707 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
POP4O95707 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POP4O95707 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POP4O95707 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POP4O95707 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POP4O95707 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POP4O95707 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POP4O95707 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POP4O95707 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POP4O95707 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POP4O95707 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POP4O95707 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POP4O95707 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POP4O95707 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POP4O95707 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POP4O95707 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POP4O95707 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POP4O95707 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POP4O95707 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POP4O95707 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POP4O95707 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
POP4O95707 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POP4O95707 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POP4O95707 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POP4O95707 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POP4O95707 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POP4O95707 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POP4O95707 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POP4O95707 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POP4O95707 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POP4O95707 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POP4O95707 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POP4O95707 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POP4O95707 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
POP4O95707 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POP4O95707 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POP4O95707 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POP4O95707 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POP4O95707 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POP4O95707 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POP4O95707 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POP4O95707 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms