Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPAG9O60271 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
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