Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MTSS1O43312 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms