Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms