Protein–RNA interactions for Protein: H3BNH8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BNH8 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3BNH8 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3BNH8 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3BNH8 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3BNH8 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3BNH8 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3BNH8 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3BNH8 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3BNH8 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3BNH8 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3BNH8 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3BNH8 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3BNH8 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3BNH8 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3BNH8 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3BNH8 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3BNH8 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3BNH8 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BNH8 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BNH8 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BNH8 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BNH8 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BNH8 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BNH8 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BNH8 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BNH8 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BNH8 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BNH8 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BNH8 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BNH8 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BNH8 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BNH8 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BNH8 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BNH8 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BNH8 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BNH8 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BNH8 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BNH8 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BNH8 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BNH8 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BNH8 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BNH8 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BNH8 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BNH8 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BNH8 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BNH8 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BNH8 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BNH8 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BNH8 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BNH8 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BNH8 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BNH8 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3BNH8 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3BNH8 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3BNH8 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3BNH8 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3BNH8 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3BNH8 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3BNH8 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3BNH8 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3BNH8 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3BNH8 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3BNH8 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3BNH8 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3BNH8 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3BNH8 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3BNH8 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3BNH8 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3BNH8 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3BNH8 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3BNH8 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
H3BNH8 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3BNH8 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3BNH8 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3BNH8 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3BNH8 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3BNH8 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3BNH8 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3BNH8 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3BNH8 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
H3BNH8 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3BNH8 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3BNH8 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
H3BNH8 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3BNH8 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3BNH8 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3BNH8 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3BNH8 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3BNH8 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3BNH8 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3BNH8 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3BNH8 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3BNH8 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3BNH8 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3BNH8 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3BNH8 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3BNH8 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3BNH8 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3BNH8 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3BNH8 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms