Protein–RNA interactions for Protein: A6NJW9

CD8B2, Putative T-cell surface glycoprotein CD8 beta-2 chain, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8B2A6NJW9 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CD8B2A6NJW9 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD8B2A6NJW9 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD8B2A6NJW9 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD8B2A6NJW9 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD8B2A6NJW9 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD8B2A6NJW9 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD8B2A6NJW9 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD8B2A6NJW9 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD8B2A6NJW9 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD8B2A6NJW9 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD8B2A6NJW9 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD8B2A6NJW9 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD8B2A6NJW9 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD8B2A6NJW9 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD8B2A6NJW9 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CD8B2A6NJW9 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD8B2A6NJW9 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD8B2A6NJW9 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CD8B2A6NJW9 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD8B2A6NJW9 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD8B2A6NJW9 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD8B2A6NJW9 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD8B2A6NJW9 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CD8B2A6NJW9 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD8B2A6NJW9 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD8B2A6NJW9 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD8B2A6NJW9 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD8B2A6NJW9 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD8B2A6NJW9 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD8B2A6NJW9 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CD8B2A6NJW9 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD8B2A6NJW9 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD8B2A6NJW9 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD8B2A6NJW9 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD8B2A6NJW9 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD8B2A6NJW9 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CD8B2A6NJW9 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD8B2A6NJW9 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD8B2A6NJW9 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CD8B2A6NJW9 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD8B2A6NJW9 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD8B2A6NJW9 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD8B2A6NJW9 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD8B2A6NJW9 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CD8B2A6NJW9 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CD8B2A6NJW9 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CD8B2A6NJW9 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
CD8B2A6NJW9 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD8B2A6NJW9 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD8B2A6NJW9 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD8B2A6NJW9 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD8B2A6NJW9 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD8B2A6NJW9 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD8B2A6NJW9 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD8B2A6NJW9 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD8B2A6NJW9 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD8B2A6NJW9 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD8B2A6NJW9 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD8B2A6NJW9 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD8B2A6NJW9 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD8B2A6NJW9 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD8B2A6NJW9 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD8B2A6NJW9 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD8B2A6NJW9 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD8B2A6NJW9 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD8B2A6NJW9 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD8B2A6NJW9 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD8B2A6NJW9 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD8B2A6NJW9 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD8B2A6NJW9 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD8B2A6NJW9 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD8B2A6NJW9 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CD8B2A6NJW9 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CD8B2A6NJW9 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD8B2A6NJW9 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD8B2A6NJW9 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD8B2A6NJW9 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD8B2A6NJW9 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD8B2A6NJW9 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CD8B2A6NJW9 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CD8B2A6NJW9 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CD8B2A6NJW9 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD8B2A6NJW9 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD8B2A6NJW9 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD8B2A6NJW9 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD8B2A6NJW9 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD8B2A6NJW9 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD8B2A6NJW9 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD8B2A6NJW9 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CD8B2A6NJW9 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD8B2A6NJW9 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD8B2A6NJW9 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD8B2A6NJW9 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD8B2A6NJW9 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD8B2A6NJW9 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD8B2A6NJW9 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD8B2A6NJW9 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD8B2A6NJW9 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CD8B2A6NJW9 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms