Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A4Q9UP95 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms