Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KDM5BQ9UGL1 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM5BQ9UGL1 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms