Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

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Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTSFQ9UBX1 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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