Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
CHPF2Q9P2E5 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CHPF2Q9P2E5 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms