Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CHST12Q9NRB3 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHST12Q9NRB3 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms