Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLMPQ9H6B4 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms