Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 NRXN1-210ENST00000406316 9375 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 LPCAT2-201ENST00000262134 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 GFAP-214ENST00000588735 6538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 TRABD2B-202ENST00000606738 7034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 AC073957.3-201ENST00000609998 6758 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms