Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.2 ms