Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV19

C1orf50, Uncharacterized protein C1orf50, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf50Q9BV19 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1orf50Q9BV19 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1orf50Q9BV19 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms