Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
NICN1Q9BSH3 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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