Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 TRPV1-209ENST00000576351 2525 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
C2orf88Q9BSF0 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 KCNMA1-285ENST00000640605 3864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 TCAF2-205ENST00000444908 2976 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 MCL1-204ENST00000620947 3626 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 C9orf106-201ENST00000316786 3145 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 ACSM2B-201ENST00000329697 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 CLCNKB-202ENST00000375679 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms