Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM79Q9BSE2 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.6 ms