Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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SEC22CQ9BRL7 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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SEC22CQ9BRL7 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SEC22CQ9BRL7 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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SEC22CQ9BRL7 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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SEC22CQ9BRL7 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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