Protein–RNA interactions for Protein: Q99895

CTRC, Chymotrypsin-C, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRCQ99895 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRCQ99895 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms