Protein–RNA interactions for Protein: Q99417

MYCBP, c-Myc-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBPQ99417 TKT-203ENST00000423525 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MYCBPQ99417 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 DYNC1LI1-201ENST00000273130 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 HLA-E-201ENST00000376630 2601 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 POU2F2-216ENST00000560558 3282 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 BIRC5-201ENST00000301633 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 FANCC-210ENST00000490972 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 ZSWIM3-201ENST00000255152 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 NRXN1-259ENST00000637511 3651 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.9 ms